Aplicaciones de proteómica en ecología y evolución

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A. Cieslak
I. Ribera

Resumen

Cieslak, A., Ribera, I. (2009). Aplicaciones de proteómica en ecología y evolución. Ecosistemas 18(1):34-43.


La evolución de las características ecológicas de las especies es uno de los temas más intensamente estudiados, pero su complejidad suele limitar estos estudios a evidencias indirectas de las adaptaciones reales de los organismos. Recientemente, métodos moleculares como los "micro-arrays" y la secuenciación a gran escala han incrementado de manera notable el conocimiento de los genomas y las vías metabólicas. Con ello, ha sido posible por primera vez estudiar con detalle la interacción a nivel molecular de los organismos con su medio. Sin embargo, la investigación de los procesos bioquímicos asociados a cuestiones ecológicas y evolutivas relacionando a los organismos con sus hábitats se suele limitar a los llamados "organismos modelo". Los últimos avances en proteómica han permitido un enorme incremento de su uso en ecología y biología evolutiva. Estas metodologías son en muchos aspectos perfectamente aplicables a estudios ecológicos, ofreciendo la posibilidad de trabajar con una amplia gama de organismos. En este trabajo hacemos una breve revisión de las principales metodologías  y de cómo la proteómica se ha utilizado hasta la fecha en diferentes estudios ecológicos y evolutivos en organismos no-modelo.

Palabras clave:
expresión de proteínas; organismos no-modelo; electroforesis bidimensional; secuenciación de proteínas; diferenciación ecológica; especiación

Abstract

Cieslak, A., Ribera, I. (2009). Applications of proteomics in ecology and evolution. Ecosistemas 18(1):34-43.


The evolution of ecological traits has been subject to intense research efforts for a long time. The complexity of ecological traits usually limits these studies to indirect evidence on the actual adaptive variations. More recently, molecular methods, such as micro-arrays and large-scale genomic sequencing, considerably increased the knowledge on genomes and metabolic pathways. With this, it became possible for the first time to study in detail the interaction of organisms and their environment at the molecular level. However, the investigation of biochemical processes associated to ecological and evolutionary questions relating organisms to their habitats are typically restricted to so-called model organisms. The latest methodological advances in proteomics led to a strongly increase in their use in ecology and evolutionary biology. These approaches are in many respects suitable for ecological studies, and offer the possibility to work on a wide range of organisms. Here we briefly review the methodology and describe how proteomics has been used to date in different fields of evolutionary biology and ecology in non-model organisms.

Keywords:
protein expression; non-model organisms; bidimensional electrophoresis; protein sequencing; ecological differentiation; speciation

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