Documentación de modelos y flujos de trabajo: el siguiente reto en el manejo de información ecológica

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Francisco Javier Bonet García
Ramón Pérez-Pérez
Blas M. Benito
Antonio J. Pérez-Luque
Regino J. Zamora

Resumen

Bonet-García, F.J., Pérez-Pérez, R., Benito, B.M., Pérez-Luque, A.J., Zamora, R.J. 2013. Documentación de modelos y flujos de trabajo: el siguiente reto en el manejo de información ecológica. Ecosistemas 22(3):37-45. Doi.: 10.7818/ECOS.2013.22-3.06


Documentación de modelos y flujos de trabajo: el siguiente reto en el manejo de la información ecológica. Los modelos ecológicos se han convertido en una pieza clave de esta ciencia. La generación de conocimiento se consigue en buena medida mediante procesos analíticos más o menos complejos aplicados sobre conjuntos de datos diversos. Pero buena parte del conocimiento necesario para diseñar e implementar esos modelos no está accesible a la comunidad científica. Proponemos la creación de herramientas informáticas para documentar, almacenar y ejecutar modelos ecológicos y flujos de trabajo. Estas herramientas (repositorios de modelos) están siendo desarrolladas por otras disciplinas como la biología molecular o las ciencias de la Tierra. Presentamos un repositorio de modelos (ModeleR) desarrollado en el contexto del Observatorio de seguimiento del cambio global de Sierra Nevada (Granada-Almería). Creemos que los repositorios de modelos fomentarán la cooperación entre científicos, mejorando la creación de conocimiento relevante que podría ser transferido a los tomadores de decisiones.

Palabras clave:
metadatos; modelos ecológicos; repositorio; flujo de trabajo.

Abstract

Bonet-García, F.J., Pérez-Pérez, R., Benito, B.M., Pérez-Luque, A.J., Zamora, R.J. 2013. Documenting models and workflows: the next challenge in the field of ecological data management. Ecosistemas 22(3):37-45. Doi.: 10.7818/ECOS.2013.22-3.06


Documenting models and workflows: the next challenge in the field of ecological data management. Ecological models have become a key part of this scientific discipline. Most of the knowledge created by ecologists is obtained by applying analytical processes to primary data. But most of the information underlying how to create models or use analytic techniques already published in the scientific literature is not readily available to scientists. We are proposing the creation of computer tools that help to document, store and execute ecological models and scientific workflows. These tools (called model repositories) are being developed by other disciplines such as molecular biology and earth science. We are presenting a model repository (called ModeleR) that has been developed in the context of the Sierra Nevada Global Change Observatory (Granada-Almería. Spain). We believe that model repositories will foster cooperation among scientists, enhancing the creation of relevant knowledge that could be transferred to environmental managers.

Keywords:
metadata; ecological model; repository; workflow

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